En el marco de los convenios firmados entre Mineduc y la UAB, la institución se compromete a constituir un sistema de verificación y evaluación del avance, resultados y evaluación de impacto del desarrollo de los proyectos, conformando para tal efecto la Unidad de Coordinación Institucional (UCI).
Esta unidad constituye formalmente el vínculo entre la Universidad y el Programa Mecesup 2 para apoyar la gestión, ejecución, desarrollo y control de los proyectos en todos sus aspectos, dependiendo de la Dirección General de Investigación y Doctorados de la Vicerrectoría de Investigación y Postgrado.
La UCI realiza también la coordinación tanto al interior de la institución como con otras universidades de proyectos en red, constituyendo el vínculo entre el Director del Proyecto con la Unidad de Administración del Programa Mecesup2 (UAP).